孵化厂应建有专用蛋库，以妥善保存种蛋．蛋库要求清洁、无灰尘、隔热性能好，通风防湿，避免日光直射和穿堂风，无蚊蝇和鼠害等．在生产中，还可利用地窖、地下室来保存种蛋，有条件的种鸡场可在蛋库内安装空调器．

蛋库内的温、湿度对种蛋保存至关重要．鸡胚发育的临界温度为 23 . 9 ℃ ，库温超过临界温度鸡胚就会开始发育，但因温度不足不能满足代谢需要而很快死亡；库温低于 10 ℃ ，孵化率就会降低，低于 0 ℃ 时种蛋就会因受冻而失去孵化能力．因此，保存种蛋最适宜的温度是：保存一周以内以 15 ℃ 左右最好，一周以上以 12 ℃ 为宜．为防止蛋内水分蒸发，蛋库内相对湿度应保持在 75 % - 80 % ．室内还应注意通风，使室内无特殊气味．种蛋保存一周内不需翻蛋，超过一周则每天要以 45 度角翻蛋 1 - 2 次，防止胚胎与蛋壳发生粘连．

另外，种蛋保存期间不要洗涤，以免蛋壳表面的胶护膜被溶解破坏，加速蛋的变质。